Недостатокот на рибофлавин може да доведе до разни здравствени проблеми, вклучувајќи воспаление на аглите на усните (аголен хелитис), црвенило и лупење на кожата, чувство на печење во очите и зголемена чувствителност на светлина.
Хроничниот недостаток на овој витамин може да предизвика замор, анемија и нарушувања на растот кај децата.
Бидејќи е растворлив во вода, рибофлавинот не се складира во големи количини во телото, што значи дека треба редовно да се внесува преку храната. Со готвење на храната може да се предизвика извесна загуба на овој витамин, но тој е релативно стабилен на загревање, додека светлината лесно може да го деградира, поради што е важно правилно да се складира храната богата со рибофлавин.
